人物菌类文献中的刺芹侧耳不同发育时期转录组差异分析
为了探索刺芹侧耳在不同发育阶段（菌丝期、原基期和子实体时期）的基因表达模式，本研究运用了高通量测序技术，即RNA-Seq，对这些期间的转录组进行了深入分析。通过KEGG功能富集分析，我们发现，菌丝期中表现出差异表达的基因主要聚焦于碳代谢和氨基酸代谢途径，其中包括柠檬酸合酶、乌头酸水合酶、异柠檬酸脱氢酶、琥珀酰辅酶A合成酶以及琥珀酸脱氢酶和苹果酸脱氢酶等关键蛋白质的相关基因，其表达量显著增加，这意味着在这一时期，碳代谢和氨基酸代谢是维持能量供应的主要机制。
在原基期间，上调的差异表达基因则集中于脂肪酸代谢途径。我们通过RT-PCR定量实验验证了这些结果，发现原基期间编码脂肪酸合酯化相关蛋白质（如脂肪酸合酯ase）以及编码参与类固醇生物合成过程中的重要蛋白质（如脂科辅助钙离子 合成ase）的相应基因表达下降，而编码抗氧化系统中超氧化物歧减ase及过氧化物还原ase等关键enzymes 的相应基因，则显示出了上升趋势。这揭示了脂肪酸代谢及其与维持稳态状态和对抗生物应激反应有关联的一些关键角色。
最后，在子实体形成阶段，上调的差异表达gen们主要分布在剪接体生成与修饰过程，以及类固醇生物合成途径以及AMPK信号传递路径中，这一结果提示环境变化可能对这个特定生长阶段产生影响。总结来说，本研究为理解刺芹侧耳不同发育阶段之间转录组水平上的变化提供了新的见解，并为进一步探索其发展机制奠定基础。
